2014.09
제2대 김두철 원장 취임

2014.03
유전체 교정 연구단 신설(김진수 단장)

2014.01
첨단연성물질 연구단 신설(Steve Granick 단장)

2013.11
순수물리이론 연구단 신설(최기운 단장)
다차원 탄소재료 연구단 신설(Rodney S. Ruoff 단장)

2013.10
액시온 및 극한상호작용 연구단 신설(Yannis K. Semertzidis 단장)

2013.08
국제과학비즈니스벨트 기본계획 변경
*기초과학연구원 건립부지 이전 (둔곡지구 -> 도룡지구)

2013.07
지하실험 연구단 신설(김영덕 단장)
뇌과학 이미징 연구단 신설(김성기 단장)
국제과학비즈니스벨트 거점지구 조성 및 대덕연구개발특구의 창조경제 전진기지 조성을 위한 업무 협약서 체결
*기초과학연구원, 대전광역시, 미래창조과학부, 대전마케팅공사

2013.06
원자제어 저차원 전자계 연구단 신설(염한웅 단장)

2012.12
분자활성 촉매반응 연구단 신설(장석복 단장)
식물 노화·수명 연구단 신설(남홍길 단장)
초강력 레이저과학 연구단 신설(남창희 단장)
나노구조물리 연구단 신설(이영희 단장)

2012.07. ~ 08
인지 및 사회성 연구단 신설(신희섭 단장)
시냅스 뇌질환 연구단 신설(김은준 단장
나노물질 및 화학반응 연구단 신설(유룡 단장)
면역 미생물 공생 연구단 신설(Charles Surh 단장)
복잡계 자기조립 연구단 신설(김기문 단장)
기하학 수리물리 연구단 신설(오용근 단장)
RNA 연구단 신설(김빛내리 단장)
강상관계 물질 연구단 신설(노태원 단장)
나노입자 연구단 신설(현택환 단장)

2012.05
개원식

2011.11
기초과학연구원 법인 설립 및 초대 오세정 원장 취임