서원대학교 산학협력단에서는 서원대학교의 산학협력 사업을 지원ㆍ관리하는 조직이며 특수법인의 성격을 가지고 있다. 늘어가는 산학협력 연구활동을 체계적으로 지원하며 대학ㆍ산업체간의 공동연구개발과 신기술사업화 등 산학협력에 대한 원스톱서비스를 제공하고 있다. 산학협력참여에 따른 서원대학교 학생들의 취업지원 서비스가 동반되며, 산업체로의 기술이전 애로문제와 수요에 따른 인력부족, 학교시설 및 기자재 이용제한 등의 문제점에 대한 해결책을 제시하여 산학협력사업에 디딤돌이 되고 있다.